Nějaký metan mohl být produkován anorganickými procesy. Původním zdrojem zemského uhlíku byly vesmírné trosky, ze kterých se planeta zformovala. Pokud jsou meteority reprezentativní pro tyto trosky, uhlík mohl být dodáván v poměrně vysokých koncentracích jako uhlovodíky, jaké se nacházejí v uhlíkatých chondritových typech meteoritů. Nepřetržité odplyňování těchto uhlovodíků může probíhat zevnitř Země a některé se mohly nahromadit jako usazeniny abiogenního plynu, aniž by prošly organickou fází. V případě rozsáhlého odplyňování je však pravděpodobné, že abiogenní plyn by byl příliš difúzní na to, aby byl komerčně zajímavý. Významné nahromadění anorganického metanu dosud nebylo nalezeno.
Hélium a část argonu nacházející se v zemním plynu jsou produkty přirozeného radioaktivního rozpadu. Helium pochází z radioizotopů thoria a uranu a argon pochází z draslíku. Je pravděpodobně náhodné, že se helium a argon někdy vyskytují se zemním plynem; se vší pravděpodobností se nesouvisející plyny prostě chytily do stejné pasti.
